試料の選択

データ処理

特徴的な長さ

大気中・液中?

計算時間

ソルバー選択完了

SPMシミュレータ：高分子・ソフトマター(011a)

このページでは、高分子・ソフトマターを[μm]オーダーで、大気中環境において、1分以内の計算時間を目安としてシミュレーション計算を行うソルバとして、GeoAFMをご紹介致します。

このページは、試料の材質として高分子・ソフトマターを主に想定していますが、有機化合物・金属・半導体・無機化合物も適用対象に含まれます。

あなたの目的に合ったシミュレータとして、以下が考えられます。

GeoAFM: 高速相互予測AFMシミュレータ

特徴は、...

探針の3次元形状データ、試料表面の凹凸形状データ、測定AFM像データの3種類のデータのうち、 2種類のデータを元にして残り1種類のデータを高速で予測することができます。

純粋に幾何学的な計算によりデータを相互予測する仕組みになっています。

したがって、探針-試料間のファンデルワールス力等の相互作用、探針・試料の形状変形は考慮されません。

	測定AFM像データ
試料表面の凹凸形状データ		探針の3次元形状データ

上記のシミュレーションを実行する場合、試料の形状を表現するデータが必要となります。
様々なたんぱく質の形状データが、pdb形式と呼ばれるファイルで、Protein Data Bank http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do から提供されています。
これを利用すると、簡単にシミュレーションが実行可能です。

自分の目的に合ったシミュレーションが見つからない場合は、あるいは、試料の形状データをどうやって準備したら良いか分からない場合は、こちらまでメールでご連絡ください。
なお、このメールには、お客様がどの箇所でつまづいたかを識別するための記号が、「件名」に挿入される仕組みとなっております。