GeoAFM(高速相互予測AFMシミュレータ) CalcImage


自分のしたいシミュレーション計算に似た計算例を探してください。
説明用PowerPointファイルをダウンロードすれば、シミュレーション計算の概要が分かります。
各種データファイルもダウンロード可能です。
計算例の中には、参考Webページが示されているものもあります。
参考Webページのリンクをたどると、「SPM(走査型プローブ顕微鏡)シミュレータ操作ナビシステム」へジャンプできます。

[GeoAFM_CalcImage_Polymer_002]
探針と試料からAFM像を予測
(a) ラクトン系高分子の構造データとピラミッド型探針を使用
(b) ラクトン系高分子の構造データとダブルチップ探針を使用
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_003]
探針と試料からAFM像を予測
(a) GroEL(シャペロニン)の構造データとCone型探針を使用
(b) GroEL(シャペロニン)の構造データとダブルチップ探針を使用
[GeoAFM_CalcImage_Inorganic_001]
探針と試料からAFM像を予測
Si(111)-(7x7)DAS構造の構造データとピラミッド型探針を使用
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_009]
オリジナルの探針形状データの作成／使用 1/2
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_010]
オリジナルの探針形状データの作成／使用 2/2
(a) 先端を丸めた探針形状を作成する
(b) その探針形状データをGeoAFM計算に利用する
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_011]
P2X4受容体のAFM像
(a) 活性化前
(b) ATP存在下
[GeoAFM_CalcImage_None_001]
GIMPによるオリジナルの探針形状画像データの作成
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_012]
生体高分子ミオシンVのAFM像シミュレーション
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_013]
RhodopsinのAFM像
(a) Cytoplasmic surface
(b) Extracellular surface
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_014]
バクテリオロドプシン(bacteriorhodopsin)のAFM像
(a) 光照射前
(b) 光照射後
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_015]
タバコモザイクウィルス（TMV）のAFM像
[GeoAFM_CalcImage_None_002]
回折格子のAFM像シミュレーション
(a) ピラミッド探針先端の半角＝10°
(b) ピラミッド探針先端の半角＝20°
(c) ピラミッド探針先端の半角＝30°
(d) ピラミッド探針先端の半角＝45°
(e) ピラミッド探針先端の半角＝60°
(f) ピラミッド探針先端の半角＝75°
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_016]
球状タンパク質の粒径解析
(a) Cone探針、先端の曲率半径 32Å、半角＝45°
(b) Cone探針、先端の曲率半径 8Å、半角＝15°
(c) ピラミッド探針、先端の半角＝16°
[GeoAFM_CalcImage_Polymer_020]
整列したコネクソンのAFM像