試料の選択
データ処理
特徴的な長さ
古典論・量子論?
ソルバー選択完了
探針・試料データ
SPMシミュレータ:有機化合物(012a)
このページでは、有機化合物、高分子・ソフトマターの分子構造の入力データを作成するソフトウェアをご紹介致します。
一つ目のソフトである
SetModel
は、カーボンナノチューブ、グラフェンシート等の形状データ作成に適しています。
二つ目のソフトであるChemSketchには、有機分子の立体形状の構造最適化機能が付属しています。
このページは、 試料の材質として
有機化合物
を主に想定していますが、
高分子・ソフトマター
も適用対象に含まれます。
探針・試料形状データを作成するツールとして、以下の二つのソフトウェアが用意されています。
SetModel: 原子モデル作成
無機材料の結晶表面の形状データを生成します。結晶表面、金属基板のデータを作成するのに便利です。
ChemSketch: 有機化合物モデル作成
ChemSketchは、有機化合物分子の形状データを生成します。
ChemSketchは、フリーソフトで提供されており、
このページ
からダウンロードできます。
また、ChemSketchで作成した化学情報データのファイル形式変換には、OpenBabelというフリーソフトが便利です。
OpenBabelは、フリーソフトで提供されており、
このページ
からダウンロードできます。
SetModelとChemSketchを組み合わせると、以下のような試料データが作成できます。
Au(111)
表面上に
coronene
分子を置いた試料データ
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