試料の選択
データ処理
特徴的な長さ 古典論・量子論? ソルバー選択完了 探針・試料データ


SPMシミュレータ:有機化合物(012a)

このページでは、有機化合物、高分子・ソフトマターの分子構造の入力データを作成するソフトウェアをご紹介致します。
一つ目のソフトであるSetModelは、カーボンナノチューブ、グラフェンシート等の形状データ作成に適しています。
二つ目のソフトであるChemSketchには、有機分子の立体形状の構造最適化機能が付属しています。

このページは、 試料の材質として 有機化合物 を主に想定していますが、 高分子・ソフトマター も適用対象に含まれます。

探針・試料形状データを作成するツールとして、以下の二つのソフトウェアが用意されています。

SetModel: 原子モデル作成

無機材料の結晶表面の形状データを生成します。結晶表面、金属基板のデータを作成するのに便利です。

ChemSketch: 有機化合物モデル作成

ChemSketchは、有機化合物分子の形状データを生成します。
ChemSketchは、フリーソフトで提供されており、このページからダウンロードできます。

また、ChemSketchで作成した化学情報データのファイル形式変換には、OpenBabelというフリーソフトが便利です。
OpenBabelは、フリーソフトで提供されており、このページからダウンロードできます。

SetModelとChemSketchを組み合わせると、以下のような試料データが作成できます。

Au(111) 表面上に coronene 分子を置いた試料データ

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