高速相互予測AFMシミュレータ: GeoAFM
Cone型探針を使った、GroEL(シャペロニン)の、AFM像シミュレーション (シャペロニンは、縦140[Å]、横140[Å]、高さ200[Å]の籠のような形をした高分子です。AFM画像によって、籠の上部の穴を再現します。)
使い方動画
計算手順書(Excelファイル)
試料形状データ(pdb形式)
[pdb形式は、Protein Data Bank (
http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do
) で提供されるデータファイルの形式です。]
シミュレーション実行用プロジェクトファイル
[このページで紹介しているGeoAFMシミュレーションを実行するためのデータファイルです。 拡張子"pro"で与えられるファイルです。]
プロジェクトファイル編集画面へ
このページで紹介されているプロジェクトファイルに、簡単な編集を行うことができます。 自分の目的に合ったシミュレーションを行えるように、プロジェクトファイルの設定内容を変更することが可能です。
使用方法やその他について、ご不明な点がございましたら、こちらまでメールでご連絡ください。
なお、このメールには、お客様がどの箇所でつまづいたかを識別するための記号が、「件名」に挿入される仕組みとなっております。
上の方法でメールを出す代わりに、以下のフォームに従ってお問い合わせ頂くことも可能です。
件名:
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どのようなことで、お困りですか:
ソルバーGeoAFMの詳しい機能が分からない
探針・試料の形状データの用意の仕方が分からない
その他
詳しい質問内容をご記入ください:
お客様のご要望に応じて、有料で、弊社技術スタッフが専属のコンサルタントとして、シミュレーション計算に必要な設定ファイルをご用意することも可能です。
有料のコンサルティングを希望されますか:
はい
いいえ
お客様のご要望に応じて、有料で、弊社技術スタッフがシミュレーション計算の代行をお引き受けすることも可能です。
有料で、シミュレーション計算の代行を希望されますか:
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